如果您使用的是 MongoDB < 4.2 (参考):

db.copyDatabase("db_to_rename","db_renamed","localhost")
use db_to_rename
db.dropDatabase();

编者注：这与问题本身使用的方法相同，但无论如何都证明对其他人有用。

替代解决方案：您可以转储您的数据库并以不同的名称恢复它。正如我所经历的那样，它比db.copyDatabase().

$ mongodump -d old_db_name -o mongodump/
$ mongorestore -d new_db_name mongodump/old_db_name

http://docs.mongodb.org/manual/tutorial/backup-with-mongodump/

这是现在的官方推荐的方法对于数据库重命名，鉴于copyDatabase 去掉了在 MongoDB 4.2 中：

“copydb”命令已弃用，请改用以下两个命令：

1. mongodump（备份数据）
2. mongorestore（将数据从 mongodump 恢复到新的命名空间）

注意：希望这在最新版本中有所改变。
您不能在 MongoDB 4.0 mongod 实例（不管 FCV 值）和 MongoDB 3.4 及更早版本的 mongod 实例之间复制数据。https://docs.mongodb.com/v4.0/reference/method/db.copyDatabase/

警报: 嘿伙计们在复制数据库时要小心，如果你不想弄乱单个数据库下的不同集合。
下面教你如何重命名

> show dbs;
testing
games
movies

要重命名您，请使用以下语法

db.copyDatabase("old db name","new db name")

例子：

db.copyDatabase('testing','newTesting')

现在您可以通过以下方式安全地删除旧数据库

use testing;

db.dropDatabase(); //Here the db **testing** is deleted successfully

现在想想如果您尝试用现有数据库名称重命名新数据库名称会发生​​什么
例子：

db.copyDatabase('testing','movies');

所以在这种情况下，所有的集合（表）测试将被复制到电影数据库。

从 4.2 版开始，copyDatabase已弃用。从现在开始，我们应该使用：mongodump和mongorestore.
假设我们有一个名为：old_name我们想把它重命名为new_name.
首先我们必须转储数据库：

mongodump --archive="old_name_dump.db" --db=old_name

如果您必须以用户身份进行身份验证，请使用：

mongodump -u username --authenticationDatabase admin \
          --archive="old_name_dump.db" --db=old_name

现在我们将数据库转储为一个名为：old_name_dump.db.
要使用新名称恢复：

mongorestore --archive="old_name_dump.db" --nsFrom="old_name.*" --nsTo="new_name.*"

同样，如果您需要进行身份验证，请将此参数添加到命令中：

-u username --authenticationDatabase admin

参考：https://docs.mongodb.com/manual/release-notes/4.2-compatibility/#remove-support-for-the-copydb-and-clone-commands

虽然 Mongodb 没有提供 rename Database 命令，但它提供了 rename 集合命令，它不仅修改了集合名称，还修改了数据库名称。

{ renameCollection: "<source_namespace>", to: "<target_namespace>", dropTarget: <true|false>  writeConcern: <document> }

db.adminCommand({renameCollection: "db1.test1", to: "db2.test2"})

这个命令只修改元数据，开销很小，我们只需要遍历下所有的集合db1, 重命名为db2实现重命名数据库名称。
你可以在这个 Js 脚本中做到这一点

var source = "source";
var dest = "dest";
var colls = db.getSiblingDB(source).getCollectionNames();
for (var i = 0; i < colls.length; i++) {
var from = source + "." + colls[i];
var to = dest + "." + colls[i];
db.adminCommand({renameCollection: from, to: to});
}

使用此命令时要小心

renameCollection 具有不同的性能影响，具体取决于目标命名空间。
如果目标数据库与源数据库相同，renameCollection 只是更改命名空间。这是一个快速操作。
如果目标数据库与源数据库不同，renameCollection 会将源集合中的所有文档复制到目标集合。根据集合的大小，这可能需要更长的时间才能完成。